引证《黄庭经》本文：
“上有魂灵下关元，左为少阳右太阴，后有密户前生门，出日入月呼吸存。”(《内景经》第二章)
“上有黄庭下关元，后有幽阙前命门。”(《外景经》)
“黄庭真[中]人衣朱衣，关门牡龠阖两扉，幽阙使[侠]之高巍巍，丹田之中精气微。”(《外景经》)
魂灵即心神。关元在脐下三寸，左阳右阴，言其理耳，若必求藏府经络部位以实之，恐近于穿凿。密户在身后腰部。生门即脐。涵虚子云：“合上下前后左右，暗藏一个中字，此中乃虚无窍也。外日月一往一来，内日月一颠一倒，绵绵呼吸，均在此虚无窍中。”今按呼为出，吸为入，出为辟，入为阖，辟为阳，阖为阴，阳为日，阴为月，故曰“出日入月呼吸存”。黄庭之下即是关元，关元之上即是黄庭，故曰：“上有黄庭下关元”。《内景经》云“上有魂灵下关元”，则谓黄庭之上有心神，黄庭之下有关元耳，辞虽异而义同。幽阙即生门，生门即脐，针灸家名为神阙，又名气舍。命门即密户，在背脊骨第十四椎下，即第二腰椎骨之部，修炼家以心神注守黄庭，名曰黄庭真人。心色本赤，故曰衣朱衣。神入气中，气包神外，如牝牡之相衔，故曰牡龠。阖两扉者，喻阴阳相纽。高巍巍者，即《参同契》所云“先天地生，巍巍尊高”之意。丹田者，乃结丹之所，如播种子于田中，自然生苗结实，成熟可期，故名曰田。精气微之微字，最宜领会，如易教之洁净精微，老氏之微妙玄通，方尽其用。盖丹道虽不外乎积精累气而成，然徒知执著精气之粗迹，将何以臻神化哉。
附注：后世丹书所言黄庭之部位，与本经微有不同，然大体无妨，可不具论。
第二章泥丸
泥丸即上丹田，在头顶中，针灸家名百会穴，乃脑也，为修持最重要之关键。当行功时，运周天火候，必后升前降，升到泥丸终，降自泥丸始，所谓还精补脑也。
夫脑髓之体极精，脑髓之用至灵，其成也，乃间接由元气化生。其亏也，非物质直接所能补足。人当中年以后，每患脑力薄弱，常欲求助于助于药，然药无补脑之效。惟有修持功夫借阴阳升降之机，化生灵质，日积月累，方可使脑髓渐充，回复原状，或更觉超胜，于是性有所寄而命有所归。
引证《黄庭经》本文：
“至道不烦诀存真，泥丸百节皆有神。”“一部[面]之神宗泥丸，泥丸九真皆有房，方园一寸处此中。”“但思一部寿无穷，非各别住居脑中。”(《内景经》第七章)
“琼室之中八素集，泥丸夫人当中立。”(《内景经》第二十一章)
“保我泥丸三奇灵，怡淡闭观内自明。”(《内景经》第二十一章)
“问谁家子在我身，此人何去入泥丸。”(《内景经》第十九章)
道法以简要为贵。口诀虽多，重在存真。存即存想，真即真人，言存想吾身真人之所在也。真人即神。虽周身百节皆有神，惟泥丸之神为诸神之宗。泥丸一部，有四方四隅。并中央，共九位，皆神之所寄，而当中央方园一寸处乃百神总会。修炼家不必他求，但存思一部之神已可享无穷之寿。因此一部之神非散居别处，而居脑中。脑为人身之宰，得其之宰，则易为功也。琼室即脑室。八素即四方四隅之神。泥丸夫人即脑室中央之神。名为夫人者，谓脑属阴性，宜静不宜动。静则安，动则伤，本于老子守雌之义也。三奇即三元。三元即元精、元气、元神。恬淡谓节嗜欲，少谋虑。闭视为闭目返观。此言保养脑中精、气、神之法，惟在返观内照也。谁家子乃内丹之喻名。内丹既结于下田，是不可不迁。迁将何去?即上入泥丸。盖返观内照，乃静以养性之功，丹成上迁，乃动以凝命之术，作用虽异，道理则同。
第三章魂魄
自来言魂魄者，理论至赜，不可毕陈，挈其大纲，约有十说：
一、以阴阳论魂魄者。《礼祀》陈氏注曰：“魂者阳之灵而气之英，魄者阴之灵而体之精。《淮南子》高诱注曰：“魂者阳之神，魄者阴之神。”
二、以五行论魂魄者。《朱子全书》曰：“魂属木，魄属金，所以说三魂七魄是金木之数也。”
三、以五藏论魂魄者。《内经》云：“心藏神，肝藏魂，肾藏精，肺藏魄。”“随神往来者谓之魂，并精出入者谓之魄。”此言魂与神为一家，魄与精的一家，正合丹道东三南二，木火为侣，西四北一，金水同宫之说。
四、以鬼神论魂魄者。《礼．祭义》曰：“气也者，神之盛也。魄也者，鬼之盛也。”气即魂意。魂与气古人常合为一谈，如“延陵季子骨肉归于土，魂气无不之”之语，可见。
五、以动静论魂魄者。《性理大金》引宋儒说，云：“动者魂也，静者魄也。”动静两字括尽魂魄。凡能运用作为皆魂使之尔，魄则不能也。
六、以升降论魂魄者。《朱子全书》曰：“人将死时热气上出，所谓魂升也，下面渐冷，所谓魄降也。”
七、以志气论魂魄者。《朱子全书》引苏氏《易解》曰：“众人气胜志而为魄，志胜气而为魂。”
八、以思量与记忆论魂魄者。宋儒黄勉斋曰：“人只有个魂与魄，人记事自然记得底是魄，如会恁地搜索思量底便是魂。魂主经营，魄主受纳。”
九、以知觉与形体论魂魄者。《礼．祭义》陈氏注曰：“人之知觉属魂，形体属魄，如口鼻呼吸是气，那灵处便属魂，视听是体，那聪明处便属魄。”
十、以生成之先后论魂魄者。《春秋左氏传》云：“人生始化曰魄，既生魄，阳曰魂。”后儒为之解曰：始化是胎中略成形时，人初间才受得气，便结成个胚胎模样是魄，既成魄，便渐渐为动，属阳曰魂。
以上诸说，各有不同，合而观之，或可于中取得一较为明确之印象，至其相互之关系则犹有说焉。《内经》曰：“魂魄毕具，乃成为人。”薛生白注曰：“气形盛则魂魄盛，气形衰则魂魄衰。魂是魄之光焰，魄是魂之根柢。魄阴主藏受，故魄能记忆在内。魂阳主运用，故魂能动作发挥。二物本不相离，精聚则魄聚，气聚则魂聚，是为人物之体，至于精竭魄降，则气散魂游，而无所知矣。”又，朱子曰：“无魂则魄不能以自存，今人多思虑役役，魂多与魄相离，老氏便只要守得相合。老子云，载营魄，是以魂守魄。盖魂热而魄冷，魂动而魄静，能以魂守魄，则魂以所守而益静，魄以魂而有生意。魂之热而生凉，魄之冷而生煖，惟二者不相离，故其阳不燥，其阴不滞，而得其和矣。不然则魂愈动而魄愈静，魂愈热而魄愈冷，二者相离，则不得其和而死矣。水，一也。火，二也。以魂守魄，以二守一，则水火因济而不相离，所以永年也。”朱说颇合于丹家魂魄相拘之旨。
引证《黄庭经》本文：
“百谷之实土地精，五味外美邪魔腥，臭乱神明胎气零，那从返老得还婴，三魂勿勿魄糜倾，何不食气太和清，故能不死入黄宁。”(《内景经》第三十章)
“玄元上一魂魄炼，一之为物最罕见[叵卒见]，须得至真乃顾盼，至忌死气诸秽贱。”(《内景经》第二十七章)
“魂欲上天魄入渊，还魂返魄道自然。”(《外景经》)
“垂绝念神死复生，摄魂还魄永无倾。”(《内景经》第十一章)
“和制魂魄津液平。”(《内景经》第十一章)
“高拱无为魂魄安。”(《内景经》第二十三章)
人赖百谷以养身，调五味以悦口，而大患即由此而生。荤腥臭气足以秽乱吾人之神明，致使胎中所受之先天元气雕零殆尽，如何能得返老还童之效？魂飘魄丧，后悔何追。若能渐绝谷食，专心食气，保养太和，则可长生。然修持之道至为玄妙，阴阳不可偏胜，魂魄必宜合炼。魂魄合炼者，即是由后天之阴阳复归于先天之一气。但此气最不易得，有真有伪。真者纯是清灵生气。伪者中含秽质死气，乃大忌也。道家所以贵乎魂魄相拘者，因魂之性每恋魄，魄之性每恋魂，不忍分离。不幸以人事之逼迫，使魂不能不升，魄不能不降，魂魄分离则人死矣。返还之道亦是顺其魂魄自然相恋之性而已，夫人当生命垂绝之时，苟一念至诚，存想吾人身中元神，尚可多延残喘，况知魂魄相拘之道者，岂有倾危之患乎。夫摄魂还魄，虽有作用，惟贵在和平，而不可偏激。偏则不和，激则不平。苟魂魄能和，则气可化津，津亦化气，周身津气润泽流通，自无不平之患矣。修炼之术先有为而后无为，和平之极，归于静定，魂魄自然安宁。
第四章呼吸
前三节虽略具理论，尚未言明学者致功之方。丹诀数十家，深浅各别，而其下手之诀皆不外乎呼吸作用。气存则人生，气竭则人死，呼吸所关，顾不重欤。普通之人徒知以口食谷，不知以鼻食气。虽终日呼吸不断，然此等呼吸大部出多入少，粗而短，不能细而长，急而浅，不能缓和深，乃修持之大忌也。修持之道贵在以神取气，使神入气中，气包神外，打成一片，结成一团，纽成一条，气成一点，则呼吸归根，不至于散漫乱动，而渐有轨辙可循，如是者久之，即可成胎息。何谓胎息?即呼吸之息氤氲布满于身中，一开一阖，遍身毛窍与之相应，而鼻中反不觉气之出入，直到呼吸全止，开阖俱停，则入定出神之期不远矣，今日《黄庭经》所论之呼吸乃胎息以前之初步，学者习之既久，可以却病延年。
引证《黄庭经》本文：
“仙人道士非有神，积精累气以成真，人皆食谷与五味，独食太和阴阳气。”(《外景经》)