随后大部明军将士也是先后登城，到了这个时候，宁夏城内叛军，真正是大势已去。
九月十日。
城内的哱拜等人，见南关己失，己方大势已去，急忙将前总兵张杰放下城，请求招安。总督叶梦熊，佯为应允，仍然大造攻城器具。
监军梅国桢惮哱氏父子之强，不敢轻信妄动。他找到南关居民一个与哱拜相识的卖油郎李登，赐他酒食，授以密计，李登受命而去。
他来到东门，给哱承恩一封梅国桢写的信，又对他道：“哱氏曾有安塞功，监军不忍骈诛，特令登赍呈密札，给与将军。将军如听登言，速杀刘、许自赎，否则请即杀登。”
哱承恩听了不由非常心动。
李登又到刘东阳，许朝的军营中，先给梅国桢密信，接着又劝二人道：“首乱是哱氏，二位将军本系汉将，何故从哱氏作乱，甘心婴祸？试思镇卒几何，能当大军？将军所恃，不过套援，今套部又已被逐，区区杯水，怎救车薪？为将军计，速除哱氏，自首大营，不特前愆可免，且有功足赏。”
李登不愧说客，听了他的话后，刘东阳，许朝二人也是非常心动。
不过李登说客后，在哱拜父子这边，哱拜担忧梅国桢之言不足重，索要总督叶梦熊的免死凭据，刘东阳，许朝二人也有这样的心思。当晚，李如松驰往叶梦熊处，要了几份印信执照，分别给梅国桢、李如松、朱正色等人，见机行事。
相继的，哱拜父子，刘东阳，许朝等人得到了叶梦熊的免死凭据，各人中计，相互猜疑。
十五日夜，刘东阳杀土文秀。
十六日早，哱承恩、毕邪气相约往南关杀许朝。继而毕邪气往北关杀刘东阳，分别将其首级悬于城上，敛兵乞降。李如松，萧如薰，黄来福等官兵陆续登城，揭示安民，并搜获宁夏巡抚关防，及征西将军印各一颗。
十七日，宁夏城大开南门，哱承恩出城迎接叶梦熊，梅国桢，朱正色等文官们入城。
进入城内，只见满目疮痍，城内饥民无数，朱正色不由叹道：“数月征战，今日宁夏终于平定，这都是熊公之劳。”
叶梦熊抚须缓缓道：“哱氏仍强，如其不除，宁夏镇恐永无宁日。”
朱正色听了不由一怔。
进入城后，叶梦熊，梅国桢，朱正色等人一边慰问宗室百姓，一边向上驰书奏捷。城破后，入城明军松懈，各将官都与原乱军欢饮，如同兄弟一般。只有黄来福的山西镇军队还是严阵以待，毫不松懈，黄来福也不进入哱府，众将官都不能理解。
黄来福私下向叶梦熊进言：“哱氏家丁尚多，诸将皆欢饮其室，恐事有变。”
叶梦熊听了，大吃一惊，急忙传令李如松，诸将才悚然整兵。接着李如松又得到叶梦熊将令，让他传示诸将：“本日定要杀尽哱氏，有不依令者，军法从事！”
很快的，哱承恩刚从梅国桢处出门，就被浙兵绑缚。老总兵牛秉忠正在哱拜家与哱拜吃午饭，闻外面有兵喊叫声，知道哱承恩被擒，立时出门。
哱拜失魂落魄，知道大势已去，合家自焚而死。哱拜家丁俱被明军搜杀。其子哮承宠，养子哮洪大等人均被俘虏。
叶梦熊上奏：“宁夏大逆，皆哱贼父子造谋，因臣前后施间，以离其心，遂手刃东阳等。妄求脱罪家丁尚二千人，真夷过半，恐奔虏构祸。朔方终非我有，臣痛心切齿，会同巡抚朱正色、监军御史梅国桢，授计总兵李如松等限十七日灭哱氏。哱承恩冲出至南关，杨文登时擒获。李如松同如樟攻围哱拜，贼丁披甲捣死拒敌，用火攻之，如樟扑入斩首，真夷尽戮！”
万历二十年九月十七日，公元1592年10月24日。
到了这天，长达七个月的宁夏之乱终于平定，万历三大征第一征告下帷幕。
宁夏之乱平定后，关于行赏论功，由于廷议不一，各报立功者之多，一时难以甄别。所以一直到了第二年的四月，才封爵已定。
文官以叶梦熊为首，叶梦熊迁右都御史兼兵部右侍郎，阴一子世锦衣千户。
朱正色迁右副都御史，阴一子世锦衣百户。
梅国桢迁大仆少卿，阴一子世锦衣百户。
魏学曾以原官致仕。
又颁诏令宁夏庆王世子帅锌袭封，王妃方氏，建祠旌表，不没贞节，给银一万五千两。
武官以李如松为首，李如松进都督，加宫保衔，世荫锦衣指挥同知。
萧如熏进都督同知，阴一子世锦衣指挥佥事。其夫人杨氏也受到万历帝的表彰，特为她建立一座功德牌坊。
擢升麻贵为延绥镇总兵官，阴一子世锦衣百户。
擢升董一元为辽东镇总兵官，阴一子世锦衣百户。
擢升黄来福为山西镇总兵官，阴一子世锦衣百户。
余者刘承嗣、李如樟、杨文、牛秉忠等各加级有差，其余死伤的军将，也各有抚恤。
万历二十年十一月戊辰，万历帝御午门，受宁夏俘，立磔哱承恩、哱承宠、哱洪大等。本月，又免畿内、浙江、河南等各受灾诸府蠲租。十二月甲午，以宁夏贼平，告天下。
是年，暹罗、土鲁番入贡。